Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO2P25791 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMO2P25791 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms