Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5AP20339 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RAB5AP20339 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RAB5AP20339 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RAB5AP20339 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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