Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms