Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms