Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOC1P02654 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms