Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LTAP01374 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LTAP01374 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LTAP01374 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LTAP01374 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LTAP01374 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LTAP01374 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LTAP01374 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LTAP01374 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LTAP01374 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LTAP01374 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LTAP01374 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LTAP01374 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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LTAP01374 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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LTAP01374 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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LTAP01374 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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LTAP01374 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LTAP01374 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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