Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF3IP2O43734 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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