Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms