Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms