Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCRIP1C9JLW8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCRIP1C9JLW8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms