Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms