Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms