Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TPRKBQ9Y3C4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms