Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms