Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms