Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NRDE2Q9H7Z3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms