Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZYG11BQ9C0D3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms