Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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