Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRBNQ96SW2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRBNQ96SW2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms