Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM41Q8WV44 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms