Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC38A9Q8NBW4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC38A9Q8NBW4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms