Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL34Q8N239 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms