Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF6

ANKRD18A, Ankyrin repeat domain-containing protein 18A, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD18AQ8IVF6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD18AQ8IVF6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD18AQ8IVF6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms