Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms