Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM236Q5W0B7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms