Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HACD4Q5VWC8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HACD4Q5VWC8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms