Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PERM1Q5SV97 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PERM1Q5SV97 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms