Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TDRD12Q587J7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms