Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPHKAPQ2M3C7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPHKAPQ2M3C7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms