Protein–RNA interactions for Protein: Q16666

IFI16, Gamma-interferon-inducible protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI16Q16666 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFI16Q16666 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IFI16Q16666 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms