Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PPP1R1AQ13522 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPP1R1AQ13522 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms