Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKP2Q13309 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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