Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PTPN13Q12923 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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