Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFF3Q07654 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms