Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX1Q04741 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX1Q04741 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms