Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARDQ03181 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms