Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DEFA6Q01524 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms