Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN7AQ01118 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms