Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX6P78412 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX6P78412 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRX6P78412 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX6P78412 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms