Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKP1P63208 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms