Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms