Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms