Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NSG1P42857 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NSG1P42857 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NSG1P42857 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NSG1P42857 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NSG1P42857 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms