Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD12P35452 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms