Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCKARP32238 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCKARP32238 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCKARP32238 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms