Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5DP30049 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5DP30049 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms