Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms