Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRDP23468 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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