Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LHCGRP22888 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms