Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT1P21579 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT1P21579 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT1P21579 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.2 ms